基于网络药理学和分子对接探究地龙对抑郁症的作用机制
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刊名 医学研究
作者 沐奕岚 蒋彭成 (长沙医学院第一临床学院 长沙 410219) 英文名 年,卷(期) 2024年,第23期
主办单位 环宇科学出版社 刊号 2661-359X DOI 10.12421/yxyj2661-3603-2024-6-23-35

基于网络药理学和分子对接探究地龙对抑郁症的作用机制

目的:本研究运用网络药理学和分子对接技术,探究地龙治疗抑郁症的作用机制。方法:通过知网、万方等平台已发表的文献筛选出 地龙的化学成分,利用SwissTargetPrediction 数据库预测化合物的靶点,将所得靶点汇总筛选。从 GeneCards 数据库中得到抑郁症疾病相关 靶点。使用Venny2.1.0 将收集到的地龙成分靶点与抑郁症疾病靶点进行分析得到交集靶点。将地龙治疗抑郁症潜在靶点导入STRING数据 库,Cytoscape 软件对共有靶点的PPI网络数据进行特征值分析得到关键靶点,并构建“成分-抑郁症靶点”网络图。运用DAVID数据库,进 行GO功能富集分析及KEGG信号通路富集分析,然后利用在线微生信网站进行可视化分析。从PDB数据库下载其核心靶点的蛋白结构, 然后使用OpenBabelGUI 工具转换成 PDB 格式,运用AutoDock 软件进行分子对接计算,将对接结果使用PLIP网络工具进行结果分析,最 后导入Pymol软件进行可视化分析。结果:得到地龙49种有效成分,646个作用靶点,3863个抑郁症疾病靶点,303个共有靶点,25个核 心靶点。GO富集分析主要涉及蛋白质磷酸化等生物过程,酶活性等分子功能。KEGG通路主要包括NF-κB信号通路等。分子对接显示化 合物与核心靶点具有较好的结合力。结论:地龙通过多成分、多靶点实现对抑郁症的治疗作用,本研究为地龙治疗抑郁症提供了一定科学 依据,为其临床应用和进一步研究奠定了基础。

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