子宫内膜异位症（endometriosis，EMs）是育龄期女性高发的雌激素依赖性慢性炎症性妇科疾病，以子宫内膜组织异位种植生长为核心特征，临床以慢性盆腔痛、痛经及不孕为主要表现，发病机制尚未完全阐明[1]。近年来高通量测序技术推动微生物组学研究深入，证实生殖道、肠道、腹腔及口腔等多部位微生物菌群失衡与 EMs 发生发展密切相关[2]。菌群失调可通过免疫炎症激活、雌激素代谢重编程、局部微环境重塑等多重通路参与异位病灶形成、侵袭及进展，同时成为疾病无创诊断标志物与微生态干预靶点[3]。本文系统梳理 EMs 相关多部位微生物菌群特征、菌群 - 宿主互作机制、临床诊断价值及微生态调控治疗进展，总结当前研究局限与未来方向，为 EMs 病因解析、早期诊断与精准治疗提供理论依据。