目的 分析咽拭子与鼻咽拭子两种不同标本新型冠状病毒核酸检测的效果，为新型冠状病毒感染疫情防控提供技术支撑。方法 选取 2022 年 3 月 16 日至 2022 年 12 月 7 日镇江市丹徒区集中隔离点隔离的密切接触者、入境人员、中高风险返丹徒等重点人群 2693 名，并采集每名人员咽拭子 与鼻咽拭子样本，使用实时荧光定量 PCR 检测技术开展新冠病毒核酸检测，分析两种标本核酸阳性率和靶标 ORFlab 基因与 N 基因的 Ct 值。结果 共检 出阳性 235 例，总阳性率 8.73%。其中检出密切接触者阳性 120 例（120/1536），阳性率为 7.81%；入境人员阳性 56 例（56/680），阳性率为 8.24%； 中高风险返丹徒人员阳性 59 例阳性（59/477），阳性率为 12.37%。咽拭子共检出 235 例，阳性率为 8.73%；鼻咽拭子共检出 234 例，阳性率为 8.69%。 咽拭子与鼻咽拭子两种不同标本在新型冠状病毒核酸检测中阳性率差异无统计学意义（x2 =0.002，P =0.961）。咽拭子的 ORFlab 基因 Ct 值为（29.22 ±5.26），鼻咽拭子为（27.56±3.93），两类标本 ORFlab 基因 Ct 值差异无统计学意义（t=0.819，P=0.283）；咽拭子的 N 基因 Ct 值为（28.70±5.05）， 鼻咽拭子为（27.23±4.07）。两类标本 N 基因 Ct 值差异无统计学意义（t=0.795，P=0.352）。结论 咽拭子和鼻咽拭子标本采用实时荧光定量 PCR 技术 检测新型冠状病毒核酸效果无显著性差异，一致性较好。 【关键词】新型冠状病毒；咽拭子；鼻咽拭子；核酸检测；镇江市丹徒区