骨髓源间充质干细胞（Bonemarrow-derivedmesenchymalstemcells,BMSC）的分离与鉴定是理解骨骼稳态及其实验应用的基础。当前该领域主要依赖于两类技术路径：一是通过组织消化法直接获取细胞群体，二是利用特异性表面标志物进行流式分选与谱系追踪。然而，本研究结合单细胞转录组学数据分析发现，这些传统方法在方法学上存在显著局限。一方面，长骨冲洗与研磨消化等物理/化学操作极易“技术性带入”非 BMSC 谱系来源的原生生长板软骨细胞等杂质，形成异质性陷阱；另一方面，流式分选所依赖的表面标记蛋白水平与其转录组表达丰度常表现出严重的不一致性，导致细胞群体的误判。单细胞测序技术的高分辨率审视表明，传统的“群体水平”鉴定忽略了这些方法学带来的异质性源头。本综述系统梳理了现有 BMSC 获取与鉴定路径中的技术瓶颈，深刻剖析了杂质细胞带入与转录-翻译不一致的内在机制，旨在为未来的骨髓基质生物学实验设计和精确的细胞表型鉴定提供方法学审视与策略优化。